熒光顯微鏡用熒光顯微技術和透射視場觀察，可以清楚地觀察和鑒定用普通顯微鏡難以觀察到染色體標本，是生物學、細胞學、腫瘤學、遺傳學、免疫學等研究工作的理想儀器，可供科研、高校、醫(yī)療和防疫等部門使用。
顯微鏡配置大視野目鏡與熒光物鏡，視場平坦清晰，兩路光路輸出，一路用于觀察，一路用于連接攝像裝置，透射照明采用6v20w鹵素燈，亮度可調(diào)；熒光落射照明采用100w高壓汞燈，外置電源箱，配有平場物鏡與熒光物鏡即可做熒光觀察也可做普通觀察。儀器要放置在陰涼、干燥、無灰塵、酸堿、蒸汽的平臺上，不用時罩好防塵罩，將所需觀察的標本放在載物臺，上卡夾住，將各倍率物鏡裝于物鏡轉(zhuǎn)換器上，目鏡插入目鏡筒中。
操作時將標本移動到載物臺中間，先用低倍物鏡觀察。打開電源開關把亮度調(diào)節(jié)鈕移至適當位置，轉(zhuǎn)動粗調(diào)手輪將載物臺上升到能見到標本的影形，轉(zhuǎn)動微調(diào)手輪即可得到清晰的物象。光亮的選擇可轉(zhuǎn)動聚光架手輪使聚光鏡上升或下降，再調(diào)可變光欄，使光欄孔徑改變以便獲得適合各類細節(jié)標本的照明亮度。(根據(jù)觀察需要備有濾色片供使用，濾色片裝于可變光欄下部的托架上，可得到選擇的色澤。)
轉(zhuǎn)動載物臺上縱向手輪，使標本作前后方向移動;轉(zhuǎn)動載物臺上橫向手輪，使標本作左右方向移動。將所需觀察的物體移至中心觀察，然后轉(zhuǎn)至高倍物鏡或油浸物鏡進行觀察(用油鏡時需加注香柏油于標本觀察處)。熒光顯微鏡轉(zhuǎn)換觀察時(物鏡不要碰切片物體)仍能看見物體的影像，需再轉(zhuǎn)動微調(diào)手輪即可達到清晰的物象，使用完畢只要轉(zhuǎn)動粗調(diào)手輪將工作臺下降到底，再將亮度調(diào)節(jié)鈕移到亮度處，關閉電源開關。
旋出滾花螺釘，將燈座板翻出，拔除燈泡，換上新燈泡即可。使用人工光源時，將集光鏡對準底座上的螺口，把集光鏡順時針旋轉(zhuǎn)到底使其固緊，然后將顯微鏡稍微抬起，松開底座下的調(diào)節(jié)螺釘，把燈絲像調(diào)節(jié)到視場中心，再將調(diào)節(jié)螺釘擰緊，以便在照明下進行觀察。