銀杏的果實(shí)具有長(zhǎng)柄，核果為倒卵形、橢圓形或近球形，長(zhǎng)2. 5—3.5厘米。外果皮由外層的表皮細(xì)胞和內(nèi)層的兩種含有無色透明結(jié)晶體的薄壁細(xì)胞組成。呈肉質(zhì)，綠黃色，成熟時(shí)為黃色或橙黃色，被白霜，其漿汁有特殊的臭味。外種皮由5～6層圓形或長(zhǎng)圓形壁厚、孔溝清楚的石細(xì)胞組成，堅(jiān)硬致密，呈骨質(zhì)，表皮平滑，為黃白色。
銀杏的果實(shí)其先端尖或鈍，具有2～3條縱棱。內(nèi)種皮由卜—2層圓形、排列整齊的薄壁細(xì)胞組成，淡紅褐色，呈膜質(zhì)。胚乳，亦稱種仁，由含圓形、卵形、橢圓形或三角形單顆淀粉粒的胚乳細(xì)胞組成，為肉質(zhì)，細(xì)膩嫩軟，味甜而又稍苦。其臍點(diǎn)有裂縫或呈飛鳥狀。銀杏花柄上的兩個(gè)胚珠有時(shí)都能發(fā)育成果實(shí)，出現(xiàn)雙果現(xiàn)象，但短枝上的果實(shí)則多為一個(gè)。
銀杏的雄花，為倒垂的柔荑花序狀，具有總柄，簇生于短枝的葉腋，成螺旋狀排列。每一個(gè)短枝有3～8個(gè)雄花球。雄花長(zhǎng)1. 5-2厘米，花柄長(zhǎng)l—2厘米。每朵雄花有30-43個(gè)花藥柄，柄上有一對(duì)花藥，藥室縱裂，藥隔不發(fā)達(dá)，每個(gè)花藥含花粉4 000-6 000粒?；ㄋ帪殚L(zhǎng)橢圓形。其中部飽滿的花粉，比兩端的花粉先成熟。這對(duì)延長(zhǎng)傳粉期有好處?；ㄋ幒突ǚ壑泻谐视坞x狀態(tài)或結(jié)合狀態(tài)的纈氨酸、天門冬氨酸、精氨酸和賴氨酸等16種氨基酸，這些氨基酸對(duì)細(xì)胞的分化和代謝，具有十分重要的作用。
雌花聚生于短枝頂端，一般為1～8朵。每朵雌花有一珠柄。珠柄長(zhǎng)1•2-4，8厘米，下端圓細(xì)，向上逐漸扁寬，呈凹形。柄端常分兩叉，少數(shù)的為3～5叉或不分叉，各生一具有盤狀珠托的胚珠。通常只有1個(gè)胚珠發(fā)育成果實(shí)。