種子繁殖是目前蝴蝶蘭商品化生產(chǎn)中常用的方法。種子繁殖的苗稱為實生苗。蝴蝶蘭需經(jīng)人工授粉才能獲得種子，但其種子發(fā)育不全，沒有胚乳，只有一層極薄的種皮，在自然條件下播種不易成功。1922年，美國的knudson首先發(fā)明了蘭花的無菌播種技術(shù)，使蘭花經(jīng)組織培養(yǎng)無菌播種能獲得大量的植株，大大地促進了蘭花的育種、種苗生產(chǎn)和商品化栽培。
蘭花無菌播種有2種植株萌發(fā)方式。
一種是原球莖方式，種子萌發(fā)初始，都形成白色圓球形的原球莖，隨著原球莖體積的增大，其上出現(xiàn)毛狀假根，繼而原球莖轉(zhuǎn)變?yōu)榫G色，但原球莖不伸長，由原球莖頂端萌發(fā)出芽。一般原球莖均可分化成苗。附生種的蘭花以此方式萌發(fā)，蝴蝶蘭、嘉德麗雅蘭和大花蕙蘭的種子均以原球莖方式萌發(fā)。
另一種是根狀莖方式，其種子萌發(fā)時，開始也呈白色圓球形，但很快伸長成為長柱形，形成根狀莖。然后在根狀莖表面有間隙地長出一叢叢根毛狀假根，在分化培養(yǎng)基上，根狀莖的頂芽才可長出幼苗，但分化出苗率極低，地生種的蘭花以此方式萌發(fā)。
蝴蝶蘭在開花后4～6天進行授粉的成功率最高。授粉時的溫度、光照對授粉成功與否有較大的影響。用于授粉的花粉必須為鮮黃色，粘性好，松散而不板結(jié)，最好用剛開花的花粉。若花粉變成深黃色至黃褐色，壓之不會散開，這樣的花粉進行授粉通常不能成功。
授粉成功的花朵3～4個月后果莢便可進行試管無菌播種。由于果莢內(nèi)種子數(shù)量較多，1個果莢便可繁殖出成千上萬的植株。因此，一般商業(yè)上的栽培用種主要采用無菌播種法。蝴蝶蘭的實生苗目前占蝴蝶蘭全部種苗的60％～70％。
其操作步驟如下：將發(fā)育成熟蝴蝶蘭果莢用75％酒精擦洗干凈，用0.1％的hgc12消毒8～10分鐘，無菌水沖洗5次，吸干。用刀片將果莢內(nèi)細如粉塵的種子取出，置于花寶1號(n-p-k：7-9-16)+香蕉50克／升+乳蛋白2克／升+蔗糖20克／升+瓊脂8克／升的培養(yǎng)基中，播種15天可見淡綠色的已膨大了的胚，50～60天形成1．5～2毫米的原球莖。然后，轉(zhuǎn)至花寶1號或ms+bal毫克／升的培養(yǎng)基中，50～60天后長成2～3片葉的小苗。再轉(zhuǎn)至花寶1號生根培養(yǎng)基中，約60天后長成葉片間距6～8厘米的完整小苗。因此，蝴蝶蘭播種至出瓶約需5～6個月。