1、收集樣品
2、相關(guān)試劑 總rna提取試劑trezol reagent (rna提取試劑), m-mlv(cdna逆轉(zhuǎn)錄酶), rna 純化試劑, realqpcr mastermix (熒光定量pcr預(yù)混試劑)。
3、實(shí)驗(yàn)儀器 熒光定量pcr儀; pcr儀;低溫離心機(jī)。
4、總rna提取
5、cdna合成 在0.5ml的離心管中加入1µl模板總rna(1µg/µl); 2µl隨機(jī)引物(t18, 10pmol/ul);2µl 10mm dntp mix;加水至15µl體系?;靹蚝?0℃變性rna 5分鐘,冰上速冷1分鐘,離心將溶液收集至管底加入6µl 5×pcr buffer;1µl rnaseout;1µl m-mlv rt;加水至30µl體系。pcr儀中反應(yīng)條件設(shè)置 37℃延伸60min,70℃保溫15min終止反應(yīng)。合成好的cdna置于 -20 ℃保存?zhèn)溆谩?br>6、引物設(shè)計(jì)與thermal cycler protocol thermal cycler protocol合成
7、實(shí)時(shí)定量pcr 按以下反應(yīng)體系進(jìn)行: 2x realqpcr mastermix(modified dna polymerase、sybr green i、optimized pcr buffer、5mm mgci2、dntp mix including dutp)25ul;上游引物f 1 ul,下游引物r 1 ul;cdna template 2ul。定量pcr儀擴(kuò)增反應(yīng)條件設(shè)置:50 ℃ 2min ;95 ℃ 10min ;95℃ 15s --60 ℃ 60 s (40個(gè)循環(huán))。
8、pcr產(chǎn)物溶解曲線分析 將所擴(kuò)增的pcr 產(chǎn)物進(jìn)行溶解曲線分析,單峰溶解曲線表示擴(kuò)增產(chǎn)物單一,無非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。溶解曲線生成的反應(yīng)程序?yàn)? 95 ℃ 15s , 60 ℃ 15 s , 95 ℃ 15s。
注意事項(xiàng):收集標(biāo)本前必須清楚要檢測(cè)的成份是否足夠穩(wěn)定,對(duì)收集后當(dāng)天進(jìn)行檢測(cè)的標(biāo)本,儲(chǔ)存在4℃?zhèn)溆茫缬刑厥庠蛐枰芷谑占瘶?biāo)本,將標(biāo)本及時(shí)分裝后放在-20℃或-70℃條件下保存。避免反復(fù)凍融,標(biāo)本2-8℃可保存48小時(shí),-20℃可保存1個(gè)月,-70度可保存6個(gè)月,部分標(biāo)本需添加抑肽酶。