近年來，彩色馬蹄蓮栽培面積逐漸擴大，但軟腐病危害嚴重，嚴重影響種球、切花的產量和品質，造成了很大的經濟損失。
軟腐病害也稱歐氏菌病，是由胡蘿卜軟腐歐文氏菌胡蘿卜軟腐致病變種引起的。被感染的葉片和莖變?yōu)樯罹G色，有壞死斑和腐斑，并分泌黏液，最終植株倒掉。塊莖同時也開始腐爛，并有惡臭。
要有效地防治軟腐病的發(fā)生、發(fā)展，首先要了解細菌性軟腐病的發(fā)病條件：一般來說，黃色和橙色的品種比紅色和奶油色的品種容易感染；當真菌病害、蟲害或者除草操作造成植株損傷時，歐氏菌可通過這些小的傷口感染植株；栽培環(huán)境溫度高于26℃，或土壤溫度高于20℃時，特別是相對濕度大時有利于發(fā)?。煌寥赖呐潘ざ却?、排水性不好或地下水位高易感染發(fā)病；過多的使用氮肥，每公頃超過150千克的氮肥用量很容易引起歐氏菌的感染；塊莖收獲后在頭一周內未及時干燥也會感染歐氏菌。
在栽培中通常采取以下措施，能夠減少軟腐病發(fā)生的概率。
1.高畦栽培，土壤應當排水良好而且ec值要低，應小于1.5，最佳的ph值為5至7。土壤中最好不含有致病菌，特別是絲核菌和腐霉菌。種植前，根據(jù)先前所做的土壤分析加入基肥，氮含量要低，鉀含量要高，即使在生長過程中，也要使用低氮高鉀的營養(yǎng)液配方。
2.種植前，使用除草劑控制雜草，可使用草甘磷、西瑪津或百草枯來進行。對于植株萌發(fā)前雜草的控制，可使用苯嗪草酮或西瑪津。對于植株萌發(fā)后雜草的控制，可使用苯嗪草酮。為了減少對表層根系的損傷，在可看到花苞前不能用機械的方法進行除草。
3.畦面鋪設黑色地膜和覆草，在夏季可以有效降低土壤溫度，并能維持土壤溫度和濕度的穩(wěn)定。
4.栽培后期逐漸減少供水，采收前半個月進行斷水處理，待整株葉片約有一半以上黃化后即可開始采收。
5.采收時盡量避免造成不必要的傷口，并避免投擲種球。采收時若挖掘出帶有軟腐菌的種球時，應將此球隔離，盡量避免碰觸健康種球，造成相互感染。帶病種球宜集中管理丟棄，避免再放入田中，成為下次栽培季病原菌的主要來源。由于陽光直射會降低種球質量，因此當日采收后的種球宜避免置于田中，宜于當日立即處理，置于陰涼處，且應避免種球相互堆積太多，造成種球蓄積太多田間熱量，增加種球腐爛機會。
6.種球采收后，應立即置于陰涼處及高相對濕度環(huán)境下，進行愈傷處理約需3至5日；或置于強涼風下吹拂，除去田間熱量并加速傷口的愈合。愈傷期愈短，效果愈佳。待種球陰干后即可進行去葉、除根處理。處理后的種球，亦需利用強涼風吹拂將所造成傷口愈傷處理。種球處理完后，開始進行藥劑處理，以減少種球貯藏期相互感染所造成的大量腐敗。目前仍無有效的藥劑可防治軟腐病，病理專家的建議藥劑有鏈霉素加銅快得寧加鈣鎂精加展著劑互相混合后，將種球浸漬于此混合藥劑約20至30分鐘。種球浸漬完成后，宜立即用強風吹干。種球風干后，即可進入冷藏庫貯藏。
7.化學防治方面，選用72%農用鏈霉素174000倍液或77%可殺得500倍液在播種澆頭水后的2至4天內澆灌根部，第二次灌根在第一次灌根后的14至21天，第三次在第二次灌根后12至24天。在此期間每周嚴密監(jiān)視歐文氏菌感染情況，一旦發(fā)現(xiàn)感染，應立即將病株拔掉清除，以免病菌傳播。