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      2. 免疫PCR試驗(yàn)方法

        發(fā)布時(shí)間:2024-08-21
        免疫pcr試驗(yàn)方法(一)材料與方法
        1.*標(biāo)記特異性抗體的制備免疫球蛋白(如igg、igm)的fc片段上有糖基存在,因而可用能與糖基結(jié)合的biotin-hydrazide作*標(biāo)記。
        (1) 將純化的抗體(igm或igg, 0.1~1.0ml)在標(biāo)記緩沖液(0.1mol/l naac,ph值5.5, 0.1mol/l nacl)中4℃透析放置一晚。
        (2)吸取0.5ml至微量離心管中,加過(guò)酸鈉溶液至終濃度為10mmol/l,置冰浴上于暗處孵育30min,使抗體分子上的糖基氧化。
        (3)將氧化的抗體過(guò)pbs平衡的sephadex g25 pd-10預(yù)裝柱,使之與過(guò)酸鈉分開。收集蛋白峰。
        (4)向抗體管中加入biotin-lc-hydrazide(pierce)至終濃度5mmol/l,置混搖器上室溫孵育1h。
        (5)用含0.02%nan3的pbs平衡sephadex g25預(yù)裝柱,將*標(biāo)記的抗體分子過(guò)柱與游離的*分開。收集蛋白峰,保存-20℃。
        2.*標(biāo)記dna片段的制備作為將與抗體偶聯(lián)的報(bào)告dna片段,應(yīng)確保在待測(cè)抗原來(lái)源的機(jī)體dna中無(wú)同源序列,如可選用大腸桿菌的序列作為報(bào)告dna去檢測(cè)人源的標(biāo)本。dna片段大小為300~500bp,*標(biāo)記可采用pcr方法,根據(jù)報(bào)告dna的核苷酸序列合成一對(duì)引物,其中一個(gè)引物的5’端堿基上帶有*標(biāo)記。
        在0.5mlpcr管中按表將下列試劑混合。
        表pcr系統(tǒng)組成
        試 劑
        添加量
        終濃度
        10×pcr緩沖液
        10.0ul

        2.5mm 4dntp混合物
        8.0ul
        0.2mm
        50um*標(biāo)記的上游引物
        1.0ul
        0.5um
        50um*標(biāo)記的下游引物
        1.0ul
        0.5um
        15mm模板dna
        1.0ul
        1.0ug
        taq dna聚合酶
        1.0ul
        5u
        加水至 100ul
        混勻后上面覆蓋液體石蠟。
        95℃加熱5min,然后在pcr儀上按下列程序擴(kuò)增:94℃ 1min;55℃ 1min;72℃ 1min; 40個(gè)循環(huán)。后72℃延伸10min。
        加等量酚-氯仿抽提,然后加10ul 3mol/l kac,250ul無(wú)水乙醇,置-70℃30min。
        離心沉淀dna片段,用70%乙醇洗一次。
        將沉淀dna干燥后溶于te緩沖液中,保存在-20℃。
        3.制備抗體-親和素-dna復(fù)合物將*標(biāo)記的抗體與親和素按等分子濃度混合于含有1mg/mlbsa的pbs中,室溫孵育30min,再加入兩倍分子濃度的*標(biāo)記的dna片段,繼續(xù)孵育30min,后加入10倍分子濃度的*,將親和素分子上的結(jié)合部位飽和。后過(guò)凝膠過(guò)濾柱將復(fù)合物與未結(jié)合的單體分開,加入bsa達(dá)1mg/ml,分裝后凍存于-20℃。
        4.免疫pcr
        (1) 按常規(guī)elisa方法,用飽和緩沖液稀釋抗原,加到96孔塑料板或0.5mlpcr管中,4℃放置一晚。
        (2) 用pbs洗三次,然后每孔加200ul封閉液(pbs含10mg/ml bsa,1mg/ml魚精dna),室溫孵育30min。
        (3) 用tetbs(其配方:20mmol/l edta,0.02%nan3)洗三次。
        (4) 將抗體-親和素-dna復(fù)合物稀釋于含有1mg/mlbsa和0.1mg/ml魚精dna的tetbs中,每孔加50ul,室溫孵育1h。
        (5) 用tetbs洗5次,然后將塑料板或管倒置在吸水紙上拍打以控干水分。
        (6) 每管中加50ulpcr反應(yīng)液,含有表成分:
        試 劑
        添加量
        終濃度
        10×pcr緩沖液
        5.0μl

        2.5mm 4dntp混合物
        4.0μl
        0.2mm
        50um*標(biāo)記的上游引物
        0.5μl
        0.5um
        50um*標(biāo)記的下游引物
        0.5μl
        0.5um
        15mm模板dna
        0.5μl
        1.5ug
        taq dna聚合酶
        0.5μl
        2.5u
        加水至50μl
        混勻后上面覆蓋液體石蠟。
        95℃加熱5min,然后在pcr儀上按下列程序擴(kuò)增35個(gè)循環(huán):94℃ 1min;55℃ 1min; 72℃ 1min。后72℃延伸10min。
        每管取5ul作瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠電泳,溴化乙錠染色后觀察結(jié)果,如在pcr時(shí)加入了放射性核素標(biāo)記,則可用x光片顯影。
        亦可在凝膠電泳后做southern-blot,用特異性探針雜交,進(jìn)一步提高其特異性和敏感性?!?br>(二)注意事項(xiàng)
        本實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵步驟是獲得適當(dāng)?shù)目贵w-dna復(fù)合物。用鏈親和素將*標(biāo)記的抗體與*標(biāo)記的dna偶聯(lián)的方法,因每個(gè)鏈親和素分子可與四個(gè)*分子結(jié)合,因此要優(yōu)化反應(yīng)條件,以使得每個(gè)鏈親和素分子既能結(jié)合上抗體分子,又能結(jié)合上dna片段。
        此外,還可用化學(xué)方法將dna片段與抗體分子共價(jià)偶聯(lián),即將抗體分子和5’端氨基酸修飾的dna片段分別用不同的雙功能偶聯(lián)劑激活,然后通過(guò)自發(fā)的反應(yīng)偶聯(lián)到一起,比如,用n-succinimidyl-s-acetyl thioacetate(sata)活化氨基修飾的dna片段,用sulfo-succinimidyl4-(maleimidomethyl) cyclohexane-1-carboxylate(sulfo-smcc)修飾抗體分子,然后將二者在一小管中混合,通過(guò)加入鹽酸胲(hydroxylamine hydrochloride)使二者偶聯(lián)在一起。
        免疫pcr具有高敏感性。因此,抗體和標(biāo)記dna的任何非特異性結(jié)合均可導(dǎo)致嚴(yán)重的本底問(wèn)題。因而在加入抗體和標(biāo)記dna后必須盡可能*地清洗。即使有些特異性結(jié)合的抗體或標(biāo)記dna被洗掉了,亦可在后通過(guò)增加pcr的循環(huán)次數(shù)得到彌補(bǔ)。此外,應(yīng)用有效的封閉劑對(duì)防止非特異性結(jié)合也是非常重要的??捎妹撝谭酆团Q灏椎鞍鬃龅鞍追忾]劑,用魚精dna做核酸封閉劑。防止本底信號(hào)的另一個(gè)重要因素是控制污染,這也是所有敏感的檢測(cè)系統(tǒng)存在的問(wèn)題。即使每一步試驗(yàn)都做得非常認(rèn)真,重復(fù)使用同樣的引物和標(biāo)記dna均會(huì)產(chǎn)生假陽(yáng)性信號(hào)。
        免疫pcr的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是標(biāo)記dna序列*是人為選定。因此標(biāo)記dna及其引物可經(jīng)常變換,以避免由于污染造成的假陽(yáng)性信號(hào)。
        免疫pcr可以檢測(cè)到常規(guī)免疫學(xué)方法無(wú)法檢測(cè)的樣品。因此,應(yīng)用免疫pcr可在微觀水平(單細(xì)胞)檢測(cè)抗原,定量pcr產(chǎn)物可以估計(jì)某一標(biāo)本中的抗原數(shù)量,在臨床診斷中可在疾病早期抗原量很低時(shí)檢測(cè)到微量的抗原。
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