(一)形態(tài)和構造上的區(qū)別 銀杏雌株的苗木表現(xiàn)為莖干矮壯，發(fā)芽早，落葉遲的特點；成年樹葉片外緣缺刻淺，枝條開張，具層性，長枝比例小，樹冠稀疏。雄株則相反。但是，這些細微差別也受到多種因子的影響，有時變得難于辨別，只因方法簡便，故也可用作初步判斷。 (一)形態(tài)和構造上的區(qū)別 銀杏雌株的苗木表現(xiàn)為莖干矮壯，發(fā)芽早，落葉遲的特點；成年樹葉片外緣缺刻淺，枝條開張，具層性，長枝比例小，樹冠稀疏。雄株則相反。但是，這些細微差別也受到多種因子的影響，有時變得難于辨別，只因方法簡便，故也可用作初步判斷。
日本學者阪本榮作在檢查了大量銀杏的雌雄株葉柄后發(fā)現(xiàn)，雌樹葉柄下方維管束周圍有油狀空隙，而雄樹葉柄則無此構造。所以，葉柄的構造，亦可用于判斷銀杏植株的性別。
(二)對化學藥品的反應有區(qū)別 日本學者巖崎文雄，分別用重鉻酸鉀、硫酸銅、硫酸鋅、氯化鉀、2，2-二氯丙酸、2，4—d處理銀杏葉，結果都是雌樹葉子的反應明顯。處理的具體方法是：剪取銀杏枝條，先在清水中浸2天，取出后再插入0．03％的氯酸鉀溶液中，先在黑暗中放兩天，而后讓其見光，注意不要在陽光下曝曬，并換上清水，一周后雌樹枝條上的葉片先開始凋萎，再過幾天，雄樹枝條上葉片才開始凋萎。
用藥物處理判別銀杏的雌雄性別，其原理是兩者的酶系統(tǒng)有明顯的區(qū)別，特別是過氧化氫酶的活性有明顯的區(qū)別。雄樹酶活性強，解毒作用也強，所以受害較遲較少。雌樹則正好相反。由此可見，除了上述藥物，如果使用其他氧化劑處理，有可能也能得到相似的結果。
(三)酶活性和酶譜方面的差別浙江麗水林校測定了雌雄銀杏葉片過氧化氫酶的活性，發(fā)現(xiàn)雄株明顯高于雌株，其活力相差1．4倍以上。