（1）工藝選擇原則
根據(jù)《醫(yī)療機構水污染物排放標準》（gb18466-2005）
第3.1.1要求：傳染病醫(yī)院必須采用二級處理，并需進行預消毒處理。
第3.1.2要求：處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫(yī)院必須采用二級處理。
第3.1.3要求：處理出水排入城市下水道(下游設有二級污水處理廠)的綜合醫(yī)院推薦采用二級處理，對采用一級處理工藝的必須加強處理效果。
（2）常見工藝類型及特點
目前主要的醫(yī)療廢水處理技術為生物處理，主要是利用微生物的代謝，使污水中的有機污染物轉化為穩(wěn)定的無害物質，因此處理費用低，是優(yōu)先選擇的污水處理方法。選擇二級生物處理工藝，可以有效改善排水水質，減少消毒劑用量，降低日常運行成本和減少二次污染。
（3）醫(yī)療污水常用生物處理方法有：活性污泥法、生物接觸氧化法、膜生物反應器等。